Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U595 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q3U595 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q3U595 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q3U595 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q3U595 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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