Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J4

Ddb1, DNA damage-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb1Q3U1J4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddb1Q3U1J4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddb1Q3U1J4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms