Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms