Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmtk2Q3TYD6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmtk2Q3TYD6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lmtk2Q3TYD6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmtk2Q3TYD6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmtk2Q3TYD6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmtk2Q3TYD6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmtk2Q3TYD6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmtk2Q3TYD6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmtk2Q3TYD6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmtk2Q3TYD6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms