Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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