Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krt2Q3TTY5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt2Q3TTY5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt2Q3TTY5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt2Q3TTY5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt2Q3TTY5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt2Q3TTY5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt2Q3TTY5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt2Q3TTY5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt2Q3TTY5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt2Q3TTY5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt2Q3TTY5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt2Q3TTY5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt2Q3TTY5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt2Q3TTY5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms