Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ush2AQ2QI47 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms