Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vax1Q2NKI2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms