Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cers3Q1A3B0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cers3Q1A3B0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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