Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ptchd1Q14B62 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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ptchd1Q14B62 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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ptchd1Q14B62 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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ptchd1Q14B62 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ptchd1Q14B62 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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