Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spata18Q0P557 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spata18Q0P557 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms