Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbp2Q08652 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp2Q08652 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp2Q08652 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rbp2Q08652 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbp2Q08652 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms