Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnn2Q08093 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms