Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnn1Q08091 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnn1Q08091 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnn1Q08091 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnn1Q08091 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnn1Q08091 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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