Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tie1Q06806 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tie1Q06806 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms