Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp2Q06649 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms