Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r236Q05A06 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r236Q05A06 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms