Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thbs3Q05895 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Thbs3Q05895 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms