Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CkbQ04447 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CkbQ04447 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CkbQ04447 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CkbQ04447 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms