Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacna1sQ02789 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacna1sQ02789 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacna1sQ02789 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms