Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp39Q02525 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp39Q02525 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp39Q02525 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp39Q02525 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp39Q02525 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp39Q02525 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp39Q02525 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp39Q02525 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms