Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gjb2Q00977 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms