Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SeleQ00690 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SeleQ00690 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms