Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cds1P98191 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms