Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scn1bP97952 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms