Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra1P97785 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfra1P97785 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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