Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cry1P97784 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cry1P97784 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cry1P97784 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cry1P97784 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms