Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LystP97412 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LystP97412 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LystP97412 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LystP97412 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LystP97412 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LystP97412 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LystP97412 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LystP97412 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LystP97412 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LystP97412 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LystP97412 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LystP97412 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LystP97412 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LystP97412 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LystP97412 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LystP97412 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LystP97412 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LystP97412 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LystP97412 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LystP97412 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LystP97412 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LystP97412 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LystP97412 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LystP97412 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LystP97412 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LystP97412 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LystP97412 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LystP97412 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LystP97412 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LystP97412 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LystP97412 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms