Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf1aP97357 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms