Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Nkx2-3P97334 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-3P97334 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms