Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mesp1P97309 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms