Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vgll3P85442 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vgll3P85442 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms