Protein–RNA interactions for Protein: P84228

Hist1h3b, Histone H3.2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3bP84228 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hist1h3bP84228 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist1h3bP84228 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms