Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cbx1P83917 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Cbx1P83917 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Cbx1P83917 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx1P83917 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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