Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irx3P81067 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Irx3P81067 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx3P81067 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms