Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irx2P81066 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx2P81066 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms