Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otx2P80206 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms