Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ErfP70459 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ErfP70459 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ErfP70459 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ErfP70459 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
ErfP70459 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ErfP70459 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ErfP70459 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ErfP70459 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ErfP70459 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ErfP70459 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms