Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tp53bp1P70399 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tp53bp1P70399 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms