Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msx3P70354 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msx3P70354 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms