Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux2P70298 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux2P70298 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cux2P70298 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cux2P70298 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux2P70298 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cux2P70298 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux2P70298 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux2P70298 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cux2P70298 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cux2P70298 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cux2P70298 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms