Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sycp3P70281 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp3P70281 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms