Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp7P70280 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms