Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Tuba4aP68368 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tuba4aP68368 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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