Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab3aP63011 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms