Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab1AP62821 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rab1AP62821 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rab1AP62821 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab1AP62821 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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