Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrpd2P62317 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpd2P62317 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms