Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp46P62069 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp46P62069 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp46P62069 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms