Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ufm1P61961 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ufm1P61961 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms