Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms